Добрый вечер, Дмитрий!
1) Для реконструкции здания изменять вид разрешенного использования земли не требуется. При этом согласно пункту 2 Обзора практики Верховного суда от 14.11.2018 г.:
Арендатор земельного участка, находящегося в государственной или муниципальной собственности, не вправе требовать изменения вида разрешенного использования такого участка и внесения соответствующих изменений в договор аренды, заключенный по результатам торгов.
Могу предположить для чего требуется изменение ВРИ:
— превышение предельных параметров строительства при существующей ВРИ в градостроительной зоне. В этом случае необходимо ходатайствовать об отклонении от предельных параметров;
— использование нового этажа не совпадает с основными ВРИ для градзоны. В этом случае необходимо ходатайствовать о предоставлении разрешения на условно разрешенный вид использования участка или о включении указанного ВРИ в основные ВРИ в данной градзоне.
На основании пункта 3.1.1 Постановления Правительства Санкт-Петербурга «О мерах по реализации Закона Санкт-Петербурга „О Методике определения арендной платы за земельные участки, находящиеся в государственной собственности Санкт-Петербурга“ во время строительства (реконструкции) арендная плата начисляется с понижающим коэффициентом. По завершении строительства плата рассчитывается без понижающего коэффициента»;
2) Если участок в аренде, зачем еще раз выкупать право аренды?;
3) Ставка аренды за земельный участок не зависит от площади объекта, расположенного на участке. Зависит, как отмечал выше, от того находится объект на стадии строительства (реконструкции) или строительство уже завершено.
Не обратил внимание на года, точно за 2002-2003, не перепутали?