По общему правилу, свидетельство о праве на наследство выдается в любое время по истечении 6 месяцев со дня открытия наследства при условии, что все необходимые документы для выдачи свидетельства имеются в наследственном деле.
Ваш нотариус подстраховывается от ошибки и в рамках правила, что
лица, для которых право наследования возникает только вследствие непринятия наследства другим наследником, могут принять наследство в течение трех месяцев со дня окончания шестимесячного срока.
Т.е. ваш нотариус не убедился, что наследников первой очереди действительно не имеется и рассуждает так: если наследник первой очереди не объявится до истечения 6 месяцев, то он выдаст вам свидетельство спустя указанные три месяца.
Вы можете не согласиться с его логикой и подать на него жалобу в нотариальную палату или (и) в суд. Или же узнайте у него, какие документы его смогут убедить, что вы являетесь единственным наследником, после предоставления которых он вам выдаст свидетельство.