Начнут же взыскивать за фактическое пользование?

Здравствуйте,  Мария. 

Исходя из невысокой цены вопроса отвечу коротко. 

Да,  без договора могут взыскивать плату за пользование земельным участком как неосновательное обогащение в соответствии со статьёй 1102 ГК. 

Вы можете подать иск в порядке статьи 35 Земельного кодекса и требовать в судебном порядке заключения договора аренды или выкупа участка в преимущественном порядке без торгов. 

Добрый день! Вам отказали на основании п 4 ч 16 ст 11.10 ЗК РФ 

несоответствие схемы расположения земельного участка утвержденному проекту планировки территории, землеустроительной документации, положению об особо охраняемой природной территории;

ст 11.10 ЗК РФ предусмотрено

Подготовка схемы расположения земельного участка осуществляется с учетом утвержденных документов территориального планирования, правил землепользования и застройки, проекта планировки территории, землеустроительной документации, положения об особо охраняемой природной территории, наличия зон с особыми условиями использования территорий, земельных участков общего пользования, территорий общего пользования, красных линий, местоположения границ земельных участков, местоположения зданий, сооружений (в том числе размещение которых предусмотрено государственными программами Российской Федерации, государственными программами субъекта Российской Федерации, адресными инвестиционными программами), объектов незавершенного строительства.

В соответствии со п 21 ст 45 ГрК РФ 

Внесение изменений в документацию по планировке территории допускается путем утверждения ее отдельных частей с соблюдением требований об обязательном опубликовании такой документации в порядке, установленном законодательством. В указанном случае согласование документации по планировке территории осуществляется применительно к утверждаемым частям.

Полагаю, что речь идет не о том что участок изымут, а о том что схема участка под зданием должна соответствовать ППТ, вы можете попробовать внести изменения в ППТ. Не факт что утвердят. Но если не утвердят, то значит у вас будет основание не платить аренду.