Имеет ли учитель право оставить ученика стоять в пороге за опоздание на урок?

Здравствуйте, Элина! Нет не имеет право. Это противоречит закону об образовании и Трудовому кодексу. У учителя нет таких прав. 

ТК РФ

Статья 336. Дополнительные основания прекращения трудового договора с педагогическим работником

Помимо оснований, предусмотренных настоящим Кодексом и иными федеральными законами, основаниями прекращения трудового договора с педагогическим работником являются:

2) применение, в том числе однократное, методов воспитания, связанных с физическим и (или) психическим насилием над личностью обучающегося, воспитанника;

Не имеет право. И это вряд ли предусмотрено Уставом образовательного учреждения. Есть повод обратиться с жалобой в отдел образования.