Что делать если они отклонят оспаривание?

Добрый день. ГИБДД какие то меры предпринимала? Вызывали ГИБДД? 

Протокол какой то сотавлялся?

Здравствуйте, Андрей. 
если я правильно понял Вашу ситуацию, из Вашего сообщения и приложенных документов, то Вы попали в ДТП и вину свою не отрицаете. Имеются повреждения транспортного средства (ТС). И Вы не согласны с некоторыми из них, так? Согласно п. 8.4.2 заключённого договора между Вами и ООО «НТС», в случае повреждения причинённого ТС в результате ДТП, произошедшего по вине арендатора, арендатор несёт ответственность в размере 15 000 рублей. В случае, если сумма ущерба меньше, то арендатор несёт ответственность на эту сумму, то есть фактическую сумму ущерба.

Вам теперь необходимо выяснить, какова реальная сумма ущерба. Для этого необходимо спросить у специалистов, сколько будут стоить поврежденные запчасти и их ремонт. В акте осмотра указана одна запчасть. Вот и узнайте, подлежит ли она ремонту или замене, и если замене, то сколько будет она стоить, а так же, её установка. А если она подлежит ремонту, то во сколько он Явам обойдётся. 
После этого, Вам необходимо обратиться с письменным заявление в ООО «НТС», в котором Вам необходимо указать, что Вы не согласны с выставляемым Вам штрафом согласно договора и отказываетесь его платить. Вы считаете, что сумма причинённого ущерба, на много меньше и указываете сумму, а так же, её обоснование, то есть, сколько стоит заказать или отремонтировать запчасть. После, если ООО «НТС» Ваше предложение устроит, то Вы по мирному решите этот вопрос, если не устроит, то они имеют право взыскать с Вас данную сумму штрафа в судебном порядке. Если они подадут в суд, то Вам необходимо ходатайствовать о проведении судебной автотехнической экспертизы, в ходе которой и будет установлен: 1) какие повреждения могли возникнуть в результате произошедшего ДТП; 

2) какова стоимость восстановительного ремонта ТС. 
А вообще, я рекомендую Вам внимательно читать те документы, договор и т.д., которые Вы подписываете. И если что-либо произошло, то необходимо везде присутствовать, что бы осмотр проводился в Ваше присутствии и документы составлялись тоже при Вас.

Желаю Вам удачи!