Стоит ли взыскивать с него через единый расчетный центр мин обороны?

Добрый день. Николай, в данном случае Ваш спор решает в судебном заседании. В рамках искового или приказного производства. 

У вас есть два варианта дальнейшего хода действий: 

1. Обратиться к мировому судье по месту жительства должника (если не была установлена договорная подсудность) с заявлением о выдаче судебного приказа о взыскании с него денежных средств по договору займа. 

В силу статьи 122 Гражданского процессуального кодекса РФ: 

 Судебный приказ выдается, если:

требование основано на сделке, совершенной в простой письменной форме;

После получения заявления мировой судья может как отказать в выдаче судебного приказа, так и выдать судебный приказ. Если судебный приказ Вам будет выдан, то вы должно будете обратиться к судебным приставам с судебным приказом для возбуждения исполнительного производства и уже приставы будут взыскивать денежные средства с его дохода.

2. Обратиться к мировому судье по месту жительства должника (если не была установлена договорная подсудность) с исковым заявлением о взыскании денежных средств по договору займа. Здесь, если решение будет в ваше пользу, то после его вступления в законную силу — получаете исполнительный лист и направляете его приставам. 

Вы написали:

Я в москве а человек в волгоградской области

Это не проблема, поскольку в силу статьи 167 Гражданского процессуального кодекса РФ: 

5. Стороны вправе просить суд о рассмотрении дела в их отсутствие и направлении им копий решения суда.

Надеюсь Вам помог мой ответ, если остались вопросы или если Вам потребуется помощь в составлении документов, то вы можете обратиться ко мне в чат.