Здравствуйте, Татьяна.
Как минимум — заключить с сестрой договор займа, в котором прописать, что заем выдается путем исполнения за сестру обязательств по кредитному договору такому-то (указать все существенные реквизиты и данные) и сроком возврата долга «по требованию», а когда выплатите ипотеку и снимете залог, произвести зачет денежного долга сестры на квартиру. Риск — она откажется отдать квартиру, а деньги будете взыскивать «до морковкиного заговенья». Если у сестры есть другое жилье, разумно заключить договор займа под залог этого жилья (у нее будет стимул).
Другой вариант — заключить предварительный договор купли-продажи квартиры со сроком заключения основного договора после погашения ипотеки а вносимые Вами платежи зачитывать в счет платы за квартиру.
По-хорошему-то надо бы сразу заключать договор купли-продажи, но банк согласия не даст и наверняка в договоре есть запрет на отчуждение ипотечной квартиры без согласия банка.
В случае чего пишите в чат.