Здравствуйте, Антон!
Если Вы совмещаете должности директора, бухгалтера, водителя, официанта, то целесообразнее оформлять совмещаемые должности именно путем доп.соглашения к трудовому договору (по основной должности директора) о совмещении должностей (бухгалтера, водителя, официанта).
Как указано в ст. 60.2 Трудового кодекса РФ:
С письменного согласия работника ему может быть поручено выполнение в течение установленной продолжительности рабочего дня (смены) наряду с работой, определенной трудовым договором, дополнительной работы по другой или такой же профессии (должности) за дополнительную оплату (статья 151 настоящего Кодекса).
Поручаемая работнику дополнительная работа по другой профессии (должности) может осуществляться путем совмещения профессий (должностей)...
Это позволит Вам с точки зрения трудового законодательства осуществлять работу по всем должностям в пределах рабочего времени по основной должности. Если оформлять совместительство (ст. 60.1 Трудового кодекса РФ), то работа по совместительству возможна только за пределами рабочего времени по основной должности. Кроме того, существуют ограничения по продолжительности рабочего времени по совместительству. При совмещении таких ограничений нет, поскольку работа по совмещению выполняется в пределах рабочего времени по основной должности.
Что касается оплаты, то в силу ст. 151 ТК РФ размер доплаты устанавливается по соглашению сторон трудового договора с учетом содержания и (или) объема дополнительной работы.
По поводу аренды можно заключить договор аренды автомобиля с экипажем (ст. 632 Гражданского кодекса РФ). В договоре аренды как раз и предусмотреть оплату арендатором (Вашей организацией) расходов на ГСМ и ремонт автомобиля. Согласно ст. 636 Гражданского кодекса РФ, если иное не предусмотрено договором аренды транспортного средства с экипажем, арендатор несет расходы, возникающие в связи с коммерческой эксплуатацией транспортного средства, в том числе расходы на оплату топлива и других расходуемых в процессе эксплуатации материалов и на оплату сборов.