Роман!
Действительно, глава 43 Трудового Кодекса РФ, в которую входит и статья 280, дополнительно регулирует трудовые отношения с руководителем организации, при этом статья 273 так говорит о руководителе организации:
Руководитель организации — физическое лицо, которое в соответствии с настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации, законами и иными нормативными правовыми актами субъектов Российской Федерации, нормативными правовыми актами органов местного самоуправления, учредительными документами юридического лица (организации) и локальными нормативными актами осуществляет руководство этой организацией, в том числе выполняет функции ее единоличного исполнительного органа.
Принципиально важный момент — осуществление функций единоличного исполнительного органа юридического лица. По общему правилу, диреткор филиала такие функции не исполняет, у организации есть один общий руководитель, в данном случае (судя по всему) — Генеральный директор Общества.
А если так, то возможно применение таких разъяснений Верховного Суда РФ:
ПЛЕНУМ ВЕРХОВНОГО СУДА РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
ПОСТАНОВЛЕНИЕ
от 2 июня 2015 г. N 21
О НЕКОТОРЫХ ВОПРОСАХ,
ВОЗНИКШИХ У СУДОВ ПРИ ПРИМЕНЕНИИ ЗАКОНОДАТЕЛЬСТВА,
РЕГУЛИРУЮЩЕГО ТРУД РУКОВОДИТЕЛЯ ОРГАНИЗАЦИИ И ЧЛЕНОВ
КОЛЛЕГИАЛЬНОГО ИСПОЛНИТЕЛЬНОГО ОРГАНА ОРГАНИЗАЦИИ
В пункте 2 сказано так:
Действие норм главы 43 ТК РФ не распространяется на работников, осуществляющих руководство отдельными сферами деятельности организации (например, художественного руководителя театра, осуществляющего руководство творческой и художественной деятельностью театра, научного руководителя научной организации, обеспечивающего формирование приоритетных направлений и (или) тематики научных исследований) или отдельными структурными подразделениями организации, в том числе филиалами, представительствами или иными обособленными структурными подразделениями, без возложения на них функций единоличного исполнительного органа организации.
Если по трудовому договору функции единоличного исполнительного органа на Вас не возложены, то и особенности увольнения по собственному желанию, предусмотренные статьёй 280 ТК РФ, к Вам применяться не должны — действует общее правило статьи 80 ТК РФ:
Работник имеет право расторгнуть трудовой договор, предупредив об этом работодателя в письменной форме не позднее чем за две недели, если иной срок не установлен настоящим Кодексом или иным федеральным законом.
При необходимости можно обратиться в трудовую инспекцию.
Т.е. пункт в трудовом договоре является не правомерным и необязательным к исполнению?
Получается, что он противоречит требованиям закона, а потому, при желании, его можно игнорировать. Другой вариант (если вдруг передумаете увольняться) — с помощью трудовой инспекции пытаться повлиять на руководителя в плане изменения договора.