Здравствуйте, Екатерина!
Пособие по беременности и родам, согласно ст. 8 Федерального закон от 19.05.1995 №81-ФЗ, исчисляется из среднего заработка, на который начисляются страховые взносы на обязательное социальное страхование. Таким образом, период, в который Вы являлись ИП, будет засчитан только в том случае, если Вы вступили в добровольные отношения с ФСС и делали отчисления за себя.
В любом случае, согласно ст. 1.1 Федерального закон от 29.12.2006 №255-ФЗ, если Ваш средний заработок за 2 предшествующих года в пересчете на месяц окажется ниже МРОТ, то пособие по беременности и родам будет рассчитываться исходя из федерального МРОТ.