Может ли один учредитель заблокировать полномочия генерального директора и если да то какой путь у процедуры?

Здравствуйте, Сергей.

Избрание и досрочное прекращение полномочий директора относится к компетенции общего собрания участников. Для принятия такого решения необходимо большинство голосов, если уставом общества не предусмотрено большее количество голосов. 

В любом случае, если распределение долей в обществе 50/50, принять решение о смене директора одним из участников невозможно. 

Добрый день!

Вы можете внести как учредитель сведения в налоговую о недостоверности сведений об исполнительном органе (генеральном директоре), и если генеральный директор тот же соучредитель, вам нужно созвать внеочередное собрание и выбрать третье лицо — управляющего, если не доверяете друг другу. 

Также можете отправить самому директору письмо с уведомлением о вручении и описью вложения о недопустимости действий.

Вообще, это корпоративный конфликт. Нужно разбираться.