А также влияет ли это заявление на сумму больничного листа по БиР?

можете не писать, первое заявление написано до трех лет.  Прилагать заявление на замену лет для расчета для второго ребенка нужно.

м 1,5 лет, поэтому заявление на выход из первого декрета я не писала, так как на работе абсолютно ничего не сказали про это и я не знала, что такое заявление нужно написать.Правильно ли поступила Бухгалтерия? Есть ли в этом ее ошибка?

Отпуск по уходу за ребенком  предоставляется сугубо в заявительном порядке, 

ТК РФ Статья 256. Отпуска по уходу за ребенком

По заявлению женщины ей предоставляется отпуск по уходу за ребенком 

нет заявления от работника, работодатель не вправе предоставить такой отпуск, бухгалтерия предупредить может конечно. но по закону не обязана, т.е. в рамках закона они ничего не нарушили. хотя конечно могли бы подсказать.

заявление все равно придётся написать? 

Обязательно и не одно а два, выше приложил типовые формы, одно на отпуск второе на пособие.

Буду ли я получать «детские» на второго малыша до 1,5 лет, если не напишу такое заявление?

Без заявления однозначно нет, по закону только по заявлению.

 И так как у меня будет плановое кесарево сечение (а это увеличивает больничный лист по БиР) могу ли я отправить такое заявление со второй частью больничного или уже поздно?

Вы можете в любое время до достижения ребенком возраста полутора лет подать такое заявление и отпуск по уходу за ним Вам обязаны предоставить.

Но следует учитывать. что пособие по уходу начнут выплачивать с периода прекращения выплаты пособия по отпуск по БиР, атк как одновременное нахождение в двух отпусках законом не предусмотрено и выплата одновременно двух видов пособий, следует это учитывать.

А также влияет ли это заявление на сумму больничного листа по БиР? Я писала заявление на замену лет, но получила расчёт б/л копейка в копейку как за первого ребёнка.

Здесь уже следует уточняться в бухгалтерии применили они замену лет по Вашем заявлению или нет, так как если заявление такое было подано. они обязаны были применить другие года но только в случае если это приведет к увеличению пособия, если нет применять они были не вправе даже по заявлению.

В соответствии с положениями Федерального закона «Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством» от 29.12.2006 N 255-ФЗ  Статья 14. Порядок исчисления пособий по временной нетрудоспособности, по беременности и родам, ежемесячного пособия по уходу за ребенком следует что:

1. Пособия по временной нетрудоспособности, по беременности и родам, ежемесячное пособие по уходу за ребенком исчисляются исходя из среднего заработка застрахованного лица, рассчитанного за два календарных года, предшествующих году наступления… отпуска по беременности и родам, отпуска по уходу за ребенком

В случае, если в двух календарных годах, непосредственно предшествующих году наступления указанных страховых случаев, либо в одном из указанных годов застрахованное лицо находилось в отпуске по беременности и родам и (или) в отпуске по уходу за ребенком, соответствующие календарные годы (календарный год) по заявлению застрахованного лица могут быть заменены в целях расчета среднего заработка предшествующими календарными годами (календарным годом) при условии, что это приведет к увеличению размера пособия.