Загс отказывается его вносить в свидетельство

Странно конечно, что ЗАГС не внёс. Но тем не менее сейчас можете это делать через суд на основании этой статьи. Приводите в суд свидетелей, приносите общие фотографии.. . 

СК РФ Статья 50. Установление судом факта признания отцовства
 

В случае смерти лица, которое признавало себя отцом ребенка, но не состояло в браке с матерью ребенка, факт признания им отцовства может быть установлен в судебном порядке по правилам, установленным гражданским процессуальным законодательством.