Здравствуйте, Елена.
В целом, это можно оформить через отступное:
Статья 409 ГК РФ Отступное
По соглашению сторон обязательство может быть прекращено предоставлением отступного — уплатой денежных средств или передачей иного имущества.
Только нужно проверить эту сделку на корпоративные риски — например, не являются ли стороны сделки заинтересованными лицами.
Физлицо — не руководитель?
В связи с чем возник долг?
Ну и дополнительно нужно посмотреть на состояние компании — не является ли оно предбанкротным.
Потому что в такой ситуации сделку могут и оспорить, как подозрительную, заключённую с предпочтение к одному кредитору:
Федеральный закон от 26.10.2002 N 127-ФЗ «О несостоятельности (банкротстве)»
Статья 61.1. Оспаривание сделок должника
Статья 61.2. Оспаривание подозрительных сделок должника
http://www.consultant.ru/docum...
В соответствии со ст. 409 Гражданского кодекса РФ:
Так как, данное соглашение подразумевает передачу недвижимого имущества, а передача прав на недвижимость подразумевает обязательную государственную регистрацию, данное соглашение должно быть зарегистрировано в Росреестре.