Здравствуйте,
В данный ответ основывается на пп. 3 -в, п. 12.2 статьи 51 Федеральный закон от 29.11.2010 N 326-ФЗ (ред. от 01.04.2020) «Об обязательном медицинском страховании в Российской Федерации»
в) возврат медицинским работником в бюджет субъекта Российской Федерации части единовременной компенсационной выплаты в случае прекращения трудового договора с учреждением, указанным в подпункте «а» настоящего пункта, до истечения пятилетнего срока (за исключением случаев прекращения трудового договора по основаниям, предусмотренным пунктом 8 части первой статьи 77, пунктами 1, 2 и 4 части первой статьи 81, пунктами 1, 2, 5, 6 и 7 части первой статьи 83 Трудового кодекса Российской Федерации), рассчитанной с даты прекращения трудового договора, пропорционально неотработанному медицинским работником периоду;
поскольку вы уходите в декретный отпуск и при этом расторжение трудового договора у вас не происходит и он продолжает действовать, то получается что отпуск по уходу за ребенком до достижения им 3 летнего возраста входит в указанный 5 летний срок необходимый для отработки.