Здравствуйте!
Пока вы находитесь «на работе», т.е. на территории работодателя или в ином указанном работодателем месте, время, которые вы тратите, называется рабочим (см. ст. 91 ТК РФ ниже).
В период рабочего времени вы обязаны выполнять свою трудовую функцию, т.е. те должностные обязанности, которые указаны в вашем трудовом договоре. Поскольку восьмичасовое (или 12-часовое, как у вас) исполнение трудовой функции физически затруднительно, законодатель предусмотрел возможность отдыха. Время отдыха — это перерывы (или перерывы) в рабочем времени, которые работодатель обязан вам предоставить (о них подробно рассказали мои коллеги).
В период «времени отдыха» вы можете заниматься чем угодно: принимать пищу, курить, гулять, отдыхать и т.п. Это Ваше время. Рабочее время — время работодателя, которое он фактически покупает у вас, выплачивая заработную плату. Он вправе требовать от вас в это время исполнения ваших должностных обязанностей в нормальном рабочем режиме. При этом каких-либо перерывов не предусмотрено.
Работодатель вправе, но не обязан, установить дополнительные перерывы, например, для курения. Следует понимать, что при такой ситуации окончание вашего рабочего времени будет отодвигаться на более поздний срок, т.к. время таких перерывов не будет включаться в рабочее время (если сам работодатель не укажет иного).
Работодатель вправе также «закрывать глаза» на потраченное сотрудниками на курение рабочее время, но это исключительно его добрая воля. Так поступают многие организации, если данные действия не вредят рабочему процессу.
Все эти моменты должны закрепляться в Правилах внутреннего трудового распорядка, принимаемых руководителем организации.
Статья 91 Трудового Кодекса РФ:
Рабочее время — время, в течение которого работник в соответствии с правилами внутреннего трудового распорядка и условиями трудового договора должен исполнять трудовые обязанности, а также иные периоды времени, которые в соответствии с настоящим Кодексом, другими федеральными законами и иными нормативными правовыми актами Российской Федерации относятся к рабочему времени.
Следовательно, можно курить столь часто, сколько это, во-первых, не противоречит правилам внутреннего трудового распорядка (если в них ничего нет по поводу запрета этого — значит не противоречит), а во-вторых, позволяет в полной мере выполнять работу в срок, установленный работодателем. В общем, если без нареканий делаете свою работу, относительно времени курения Вам никто не вправе делать замечания.