Добрый день Максим!
Трудовым кодексом РФ запрещена какая бы то ни было дискриминация при установлении и изменении условий оплаты труда.
Вы спрашиваете:
почему организации выгодно сокращать число сотрудников в штатном расписании Головного офиса и переводить их в другие структурные подразделения?
Если под «головным офисом» имеется ввиду место нахождения единоличного исполнительного органа (например, директора), а под структурными подразделениями Вы имеете ввиду другие здания организации, то с точки зрения оплаты труда тех работников, кого туда хочет перевести работодатель, смысла в этом нет никакого.