Полагается ли мне выплата или какая то компенсация?

Если Вы проходите военную службу по контракту, то у Вас не возникает права на получение страховой выплаты, поскольку данное заболевание само по себе в силу ст. 4 ФЗ  от 28.03.1998 N 52-ФЗ «Об обязательном государственном страховании жизни и здоровья военнослужащих, граждан, призванных на военные сборы, лиц рядового и начальствующего состава органов внутренних дел Российской Федерации, Государственной противопожарной службы, сотрудников учреждений и органов уголовно-исполнительной системы, сотрудников войск национальной гвардии Российской Федерации»

не является страховым случаем.

Если Вы не планируете увольняться с военной службы, то если будет доказана вина командования в причинении вреда здоровью, выразившееся в перенесенном заболевании — то Вы можете рассчитывать на его получение по общим основаниям. 

Так по смыслу ст. 1084 ГК РФ

Вред, причиненный жизни или здоровью гражданина при исполнении договорных обязательств,а также при исполнении обязанностей военной службы, службы в полиции и других соответствующих обязанностей возмещается по правилам, предусмотренным настоящей главой, если законом или договором не предусмотрен более высокий размер ответственности.

Размер выплат в таком случае определяется с учетом требований ст. 1085 ГК РФ

1. При причинении гражданину увечья или ином повреждении его здоровья возмещению подлежит утраченный потерпевшим заработок (доход), который он имел либо определенно мог иметь, а также дополнительно понесенные расходы, вызванные повреждением здоровья, в том числе расходы на лечение, дополнительное питание, приобретение лекарств, протезирование, посторонний уход, санаторно-курортное лечение, приобретение специальных транспортных средств, подготовку к другой профессии, если установлено, что потерпевший нуждается в этих видах помощи и ухода и не имеет права на их бесплатное получение.

При заключении ВВК с формулировкой «заболевание, полученное в период службы» страховка не полагается, так как для нее нужна формулировка «военная травма».

12. При увольнении военнослужащего с военной службы или отчислении с военных сборов гражданина, призванного на военные сборы, в связи с признанием его не годным к военной службе вследствие военной травмы ему выплачивается единовременное пособие в размере:
1) 2 000 000 рублей — военнослужащему, проходящему военную службу по контракту;

Виталий Мысовский

Виталий, о данной выплате речи здесь и быть не может, поскольку установлена категория годности Б — годен к военной службе с незначительными ограничениями.

и увольнение со службы, здесь возможно разве, что по ОШМ.