Здравствуйте, Наталья!
Выписать зарегистрированных по месту жительства возможно при условии, что они выехали, вывезли свои вещи, или или по иным обстоятельствам не проживают по месту регистрации. Делается это через суд.
В вашем случае вопрос стоит о невозможности совместного проживания с собственником, поэтому в первую очередь, в суд нужно обращаться с иском о выселении таких жильцов, а затем, или одновременно с этим, о выписке.
Надеюсь, мои рекомендации окажутся для Вас полезными.
Если нужна помощь в подготовке документов в суд, можете обратиться ко мне в чат.