Здравствуйте, Вадим!
Вы спрашиваете:
Законно ли таможня арестовала судно, не принадлежащее уже правонарушителю?
Нет, незаконно. Если право собственности зарегистрировано надлежащим образом за покупателем судна, то его конфискация или арест в связи с допущенными нарушениями прежнего собственника судна явно незаконно. Это вытекает из смысла и содержания статей 235, 237-238 ГК РФ. В целом конфискация имущества в силу ст. 104.1. УК РФ возможна в связи с совершением уголовного преступления.
Статья 235. Основания прекращения права собственности
1. Право собственности прекращается при отчуждении собственником своего имущества другим лицам, отказе собственника от права собственности, гибели или уничтожении имущества и при утрате права собственности на имущество в иных случаях, предусмотренных законом.
2. Принудительное изъятие у собственника имущества не допускается, кроме случаев, когда по основаниям, предусмотренным законом, производятся:
1) обращение взыскания на имущество по обязательствам (статья 237);
2) отчуждение имущества, которое в силу закона не может принадлежать данному лицу (статья 238);
Статья 237. Обращение взыскания на имущество по обязательствам собственника
1. Изъятие имущества путем обращения взыскания на него по обязательствам собственника производится на основании решения суда, если иной порядок обращения взыскания не предусмотрен законом или договором.
2. Право собственности на имущество, на которое обращается взыскание, прекращается у собственника с момента возникновения права собственности на изъятое имущество у лица, к которому переходит это имущество.
Надеюсь, Вы поняли, что если имущество этим лицом приобретено с соблюдением всех норм права, то его арест или конфискация недопустимы. Возможно всего лишь задержание судна для проверки документов.