Что делать, если работодатель обманул с размером заработной платы?

Здравствуйте! Помогите, пожалуйста, разобраться в следующем вопросе:

Когда я устраивалась на работу, мне предложили зарплату 45 000 рублей (-13%), из них в счет оклада записали в трудовом договоре 11 500, остальную сумму обещали в виде дополнительных выплат. Но дело в том, что сумму дополнительных выплат работодатель не зафиксировал в трудовом договоре. Как я поняла, сумма надбавок вообще необязательна к указанию в трудовом договоре.

О том, что сумма зарплаты (оклад+надбавки) должна быть 45 000, по факту, прописано только в переписке с руководителем, но переписка сохранена.

В чем суть проблемы:

На данный момент работодатель не нуждается в моих услугах как специалиста, однако процедуру увольнения хочет провести с наименьшими потерями для себя. Вследствии этого предлагает уволиться с окладом за 2 месяца и оплатой за оставшийся за 3 года отпуск - тоже высчитаной только исходя из размера оклада.

Чтобы разобраться в размере положенных мне компенсаций, после юридической консультации я взяла в банке выписку переводов на зарплатную карту согласно реестру компании. Просмотрев ее, я не обнаружила поступлений на карту денежных средств в том размере, который был со мной оговорен как зарплата. То есть суммы надбавок к окладу колеблются от 9 000 до 21 000 рублей на карте, что в сумме с окладом значительно меньше оговоренной при трудоустройстве зарплаты, за исключением второй половины 2017 года, когда сумма зарплаты стала соответствовать оговоренной (после смены руководителя отдела). Сразу скажу, что зарплатных ведомостей с указанием зарплаты я никогда не получала, так как деньги приходили на зарплатную карту, которую выдали при устройстве на работу и которую я просто использовала для оплаты как любую обычную платежную карту.

В ответ на мои письменные требования выплатить мне долг по зарплате, работодатель отвечает отказом, так как сумма надбавок нигде не указана! Так же в ответ на мои требования компенсировать в полной мере неиспользуемый отпуск за 3 года, работодатель так же предлагает сумму, равную трем окладам.

В противном случае, при отказе увольняться на его условиях, работодатель угрожает уволить по статье за прогулы (Я штатный сотрудник на удаленной работе. Но дополнительное соглашение об удаленной работе работодатель «потерял», а мой экземпляр соглашения мной не был потребован при подписании, что несомненно мое упущение, хоть у меня и имеются все доказательства работы, от переписок до выполненных за время работы задач).

Из всего, описанного выше, у меня возникают следующие вопросы:

Как должна по закону высчитываться компенсация неиспользованого отпуска - из оклада, как считает работодатель - или же исходя из средней зарплаты, так как она у меня выше оклада?.. Куда обращаться, если оаботодатель в этом вопросе неправ - в суд или трудовую инспекцию?

И второй вопрос - каковы шансы взыскать в суде с работодателя компенсацию за невыплаченные в обещанном размере надбавки к окладу? При условии того, что я могу предоставить переписки по e-mail с руководителем, где обозначается сумма зарплаты с учетом оклада и надбавок. А так же могу предоставить выписки из банка о реальных размерах выплат и несоответствии их обещанным при трудоустройстве суммам.

Письменные поетензии и переговоры работодателем, к слжалению, игнорируются. Есть ли смысл обращаться в суд или лучше уволиться на условиях работодателя?

Заранее большое спасибо.