Как быть в такой ситуации и как взыскать деньги по договору?

Здравствуйте, Андрей!

В описанной Вами ситуации Вы можете истребовать свои расходы с Агента в судебном порядке. По смыслу и содержанию приложенного Вами договора, для начала нужно написать Агенту требование о их выплате. Если в течение 30 дней получите отказ или будет молчание, можете обратиться в суд о принудительном взыскании. Однако, уверенности, что иск будет удовлетворён, нет по следующим основаниям: в п. 1.2. приложенного Вами к вопросу договора написано следующее: «Услуга считается выполненной в полном объеме в одном из следующих случаях:

......................................................................................................................................

— в случае выдачи Агентом Принципалу заключения подготовленного оценочной комиссией на руки

— при подписании акта выполненных работ к настоящему договору» 

Вы же в своем вопросе пишете: «12.12 поехали в ЮК, где нам предоставили свежераспечатанное экспертное заключение, где указанна сумма выплаты за ремонт и стоимость услуг. Смутило заключение, но заверили, что оформленный отправлен был в СК. После расчетов с ЮК и подписи актов выполненных услуг»

Получается, что условия договора с Агентом выполнены в полном объеме. Насчет отправки материалов в СК именно Агентом, в договоре я что-то не нашел.

Безусловно, прежде чем обратиться в суд, надо внимательно изучить все документы, сопоставить их с реальностью. И все же, напишите Агенту требование и посмотрите что он ответит. Они-то лучше знают всю ситуацию.