За что начислили пени за уплаченный налог?

Добрый день, Игорь!
Уплата налога производится не позднее 1 декабря года, следующего за истекшим налоговым периодом, соответственно транспортный налог Вы оплатили в срок.
Вы можете обратиться в налоговую за разъяснениями. Возьмите с собой квитанцию об оплате налога.
Возможно, это пени не за текущий платеж, а за прошлые периоды. Либо платеж совершен не по тем реквизитам. Вариантов может быть множество…
В этом вопросе Вам поможет только налоговая.