Исходя из какой стоимости будет рассчитываться налоговый вычет?

Юлия, добрый вечер.

В соответствии со ст.220 НК РФ

«налогоплательщик вправе уменьшить сумму своих облагаемых налогом доходов на сумму фактически произведенных им и документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением этого имущества.

в фактические расходы на приобретение квартиры, комнаты или доли (долей) в них могут включаться следующие расходы:
расходы на приобретение квартиры, комнаты или доли (долей) в них либо прав на квартиру, комнату или доли (долей) в них в строящемся доме;

Так что если за право требования по ДДУ Вами было оплачено в размере четырех миллионов рублей, то это и есть сумма фактически понесенных расходов.

МиФНС исходит из стоимости, которая указана непосредственно в договоре долевого участия, определена сторонами и зарегистрирована в Росреестре. Дополнительные документы, которые подписываются на оставшиеся суммы — расписки, договоры о проведении ремонта в квартире — изучаются под микроскопом и отказывают в удовлетворении, т.к. не имеют отношения к покупке квартиры. Судебная практика при обжаловании подобных действий налоговиков — в большей степени на стороне МиФНС.