Что делать, если работал по медицинской лицензии с истёкшим сроком?

Здравствуйте Сергей!

Получается Вы осуществляете медицинскую деятельность  на территории инновационного центра „Сколково“? Если да, то в соответствии с ч.1 ст. 17 Федерального закона от 28.09.2010 N 244-ФЗ «Об инновационном центре „Сколково“,

Медицинская деятельность на территории Центра осуществляется медицинскими организациями и другими организациями, входящими в частную систему здравоохранения, без получения ими лицензий на соответствующие виды деятельности.

Во всех остальных случаях лицензия на осуществление медицинской деятельности действует бессрочно, в соответствии с ч.4 ст. 9 Федерального закона от 04.05.2011 N 99-ФЗ „О лицензировании отдельных видов деятельности“.

Добрый день!
Действительно, в связи с вступлением в силу Федеральный закон от 04.05.2011 N 99-ФЗ «О лицензировании отдельных видов деятельности»изменилось наименование лицензируемого вида деятельности с «медицинская деятельность» на «медицинская деятельность (за исключением указанной деятельности, осуществляемой медицинскими организациями и другими организациями, входящими в частную систему здравоохранения, на территории инновационного центра „Сколково“)».

В связи с этим имеется необходимость в переоформлении лицензии.
Перечень необходимых документов можно посмотреть здесь. 
Согласно п. 92 ст. 333.33 НК РФ необходима уплата госпошлины в сумме 750 руб. 
До окончания процесса переоформления лицензии Вы вправе продолжать свою деятельность.