Несмотря на то, что до заключения трудового договора они еще не являются работниками организации, оплата предварительных медосмотров должна производиться за счет средств работодателя. Согласно ст. 212 ТК РФ. Но на практике часто бывает как в Вашем случае.
Расходы, понесенные предприятием на оплату медицинских обследований соискателей и работников, занятых в его основной деятельности, учитываются в бухгалтерии как валовые расходы по рядовым видам деятельности. Оформление расходов бухгалтером. Непосредственная компенсация работникам денежных средств, затраченных на самостоятельное прохождение медосмотра, проводится как расчеты с персоналом по прочим операциям. Оплата услуг медицинского учреждения, с которым заключен договор обслуживания — как расчеты с контрагентами и поставщиками.
Т.е. изначально администрация учреждения нарушила норму ТК, заставив Вас за свой счет проходить первичный мед. осмотр.
В классическом варианте для защиты своего субъективного права, можно говорить о том чтоб Вы обратились в суд и Вам скорее всего выплатят по решению суда или обратились в ГИТ с заявлением о нарушении норм трудового законодательства, но это КОНФРОНТАЦИЯ с непрогнозируемыми последствиями.
Здесь надо сгенерировать ход, который не предусмотрен законодательством и приемлем для Ваших частных условий. Для примера – взять справку в лечебном заведении, что по договору №… фактически оказана услуга Вам, а не заявленному плательщику; выйти на специалиста по охране труда (ранее инженер по ОТ), который должен понимать о нарушении этой нормы и последствиях для предприятия, если официально «раздуть» это нарушение, сделав его своим соратником в возмещении денежных средств. Вариантов много и их можно обсуждать, только зная реальные условия Вашей организации.