Наличие задолженности не является основанием для отказа в согласовании акта о проведенном межевании.
Вручите официальное заявление председателю СНТ с просьбой согласовать акты, а в случае отказа — указать причину отказа в письменном виде.
В заявлении обязательно укажите, что в случае отказа от согласования акта по причинам, не связанным с нарушениями при проведении межевания, будете обращаться в суд.
Что касается Вашей задолженности по взносам, то председатель имеет право требовать от Вас погашения задолженности в судебном порядке. То, что он делает сейчас — превышение полномочий.