Как военнослужащему получить служебное жилье на всех членов семьи, если жена и дочь прописаны не при части?

Здравствуйте! Всё это глупости и незаконные ухищрения.

Да и ухудшением жилищных условий это назвать нельзя, т.к. регистрация не даёт права собственности на недвижимость.

ФЗ «О статусе военнослужащих»

ст. 15

На весь срок военной службы служебными жилыми помещениями обеспечиваются:
военнослужащие, назначенные на воинские должности после получения профессионального образования в военной профессиональной образовательной организации или военной образовательной организации высшего образования и получения в связи с этим офицерского воинского звания (начиная с 1998 года), и совместно проживающие с ними члены их семей;

Подразумевается, что ваша супруга и ребёнок обеспечены жильем по месту службы, так как имеют регистрацию. Чтобы не спорить с жилищной комиссией, снимайте их с учета и регистрируйте при части. В данном случае — это не будет считаться добровольным ухудшением жилищных условий, так как они «следуют» к месту службы военнослужащего. Все это бюрократия, но по другому только через суд.