Может ли налоговая отказать мне в предоставлении налогового вычета?

Здравствуйте!

в данном случае право на налоговый имущественный вычет у Вас возникло лишь после регистрации права в ФРС, поэтому вычет Вы можете заявить только за 2017г. а то, что Вы долго не регистрировали свое право на право получить вычет не влияет, окромя времени за который вправе заявить его.

6) для подтверждения права на имущественный налоговый вычет налогоплательщик представляет в налоговый орган:
договор о приобретении жилого дома или доли (долей) в нем, документы, подтверждающие право собственности налогоплательщика на жилой дом или долю (доли) в нем, — при строительстве или приобретении жилого дома или доли (долей) в нем;