Здравствуйте,
Для оплаты учебного отпуска действительно требуется только соответствующее заявление работника и справка-вызов. Но стоит иметь ввиду что форма справки вызова специальным образом утверждена Минобразованием России приказом от 19 декабря 2013 г. № 1368.
И состоит она из двух частей. Первая часть подается вместе с заявление перед сессией. Вторая часть подается работодателю после сессии. И в ней говорится о том, что за такой то период студент прошел курс/семестр и т.д. Скорее всего речь именно об этой второй части справки-вызова. Вероятнее всего Вами она предоставлена не была.
Приказ Минобрнауки России от 19.12.2013 N 1368 (ред. от 26.05.2015) «Об утверждении формы справки-вызова, дающей право на предоставление гарантий и компенсаций работникам, совмещающим работу с получением образования»
http://www.consultant.ru/docum...