Добрый день, Виктор!
Действительно, для подачи документов на оформление постоянной регистрации требуется присутствие собственника. При этом собственник еще должен выразить свое согласие на постоянную регистрацию конкретного лица. Подать документы от Вашего имени может любое лицо по доверенности. В том числе и жена. Доверенность необходима нотариальная.
Обратите внимание, что в доверенности в полномочиях лица должно быть указано, кого именно необходимо зарегистрировать по месту жительства. Тогда будет соблюдено условие о Вашем согласии на регистрацию.
Жене нужно будет помимо доверенности и своего паспорта привести ксерокопию Вашего паспорта. На всякий случай рекомендую взять ксерокопию свидетельства о браке и свидетельства о праве собственности на квартиру. К сожалению в зависимости от региона могут возникать различные субъективные требования на местах, поэтому лучше иметь копии документов при себе.