Какая ответственность, если директор не подал форму Р14001 в срок?

Алексей, добрый день.

Подача заявления осуществляется не позднее трех дней с момента принятия
решения.То есть с той даты, что стоит в вашем протоколе. В противном
случае должностному лицу грозит штраф в размере 5000 рублей (часть 3
статьи 14.25 КоАП РФ). Но существует такой нюанс: законом не установлено
обязательное предоставление протокола (решения) в регистрационный
орган, и, значит, единственной датой, от которой может вестись отсчет,
является дата, проставленная нотариусом на форме Р14001.

Внесение изменений сейчас возможно, но сделать это должен новый директор, так как считается, что уже отстранены от должности и не имеете права выступать заявителем.

Если компания не действует и не представляет отчетность, ее скорее всего исключат из реестра по истечении 12 мес, когда она перестала проводить обороту по счету и подавать отчетность (ст.21 Закона 129-ФЗ О гос. регистрации юр. лиц.)

Если на руках у участников есть протоколы и заявления с отметкой о принятии в отношении их выхода они уже не считаются участниками. Изменения необходимы не только для закрепления их статуса, но того, чтобы участниками их не считали третьи лица.

Если компания не ведет деятельность и со стороны ФНС к вам как директору не было претензий я бы рекомендовал направить уведомление о снятии полномочий собранием участников и указать, что Обществом не были выполнены обязательства в отношении внесения изменений в ЕГРЮЛ.