Здравствуйте, Ольга!
Обратимся к законодательству. Вот текст ч. 3 ст. 173 Трудового кодекса Российской Федерации.
Работникам, успешно осваивающим имеющие государственную аккредитацию программы бакалавриата, программы специалитета или программы магистратуры по заочной форме обучения, один раз в учебном году работодатель оплачивает проезд к месту нахождения соответствующей организации, осуществляющей образовательную деятельность, и обратно.
Как видите, работодатель оплачивает проезд к месту нахождения образовательного учреждения в полном объеме один раз в учебном году. Никакого дробления законом не предусмотрено.
С уважением, юрист Лаврентьев А.В., город Ульяновск.