Здравствуйте! Согласно ст. 1109 ГК РФ не подлежит возврату в качестве неосновательного обогащения заработная плата и приравненные к ней платежи, пенсии, пособия, стипендии, возмещение вреда, причиненного жизни или здоровью, алименты и иные денежные суммы, выплаченные гражданину в качестве средства к существованию, при отсутствии недобросовестности с его стороны и счетной ошибки.
Согласно письму Роструда от 01.10.2012 № 1286-6-1 «счетной считается арифметическая ошибка, то есть ошибка, допущенная при проведении арифметических подсчетов», т.е. случаи, когда были неправильно применены
математические действия (умножение, сложение и пр.) или описка, т.е. неверное
отражение правильно исчисленных денежных сумм в документах, на основании
которых производятся выплаты.
Если в Вашем случае счетной ошибки нет, а есть неверное применение нормативных актов или иная причина, то при отсутствии Вашей недобросовестности излишне выплаченные суммы не могут быть с вас взысканы. Кроме того, трехлетний срок исковой давности Минобороны, похоже, пропустило.
С большой долей вероятности исход судебного разбирательства может быть для Вас благоприятен.