Ольга, добрый день, если вы подадите заявление о снятии с учета в качестве плательщика ЕНВД, тогда автоматически попадете на общую систему налогообложения.
Заявление о снятии с учета организации в качестве налогоплательщика единого налога на вмененный доход для отдельных видов деятельности (форма N ЕНВД-3) (КНД 1111050) применяется — с 17 марта 2013 года.Утверждена — Приказом ФНС России от 11.12.2012 N ММВ-7-6/941@
Срок подачи — в течение пяти дней со дня прекращения предпринимательской деятельности, облагаемой единым налогом, или со дня перехода на иной режим налогообложения.
С момента закрытия обособленного подразделения просто не указываете его в декларации по ЕНВД в разделе 2 «Расчет суммы единого налога на вмененный доход по отдельным видам деятельности». Желаю вам удачи.