Здравствуйте.
На объекты недвижимости зарегистрированные в собственность до 01.01.2016г., действуют прежние правила при продаже квартиры менее 3-х лет в собственности, В случае продажи в 2016г. у вас возникает необходимость уплаты подоходного налога. Налогооблагаемой базой будет являться стоимость квартиры в договоре купли-продажи. Кадастровую стоимость учитывать Вам не требуется.
Налогооблагаемую базу вы можете уменьшить на имущественный налоговый вычет в размере фактически произведенных затрат на приобретение квартиры или на налоговый вычет 1 млн. р. Поскольку в вашем случае сумма покупки по договору совпадает с размером имущественного вычета 1 млн.р., то подтверждать расходы нет необходимости, а проще использовать вычет в 1 млн.р.
Налог (13%) необходимо будет оплатить с разницы между стоимостью продажи за минусом налогового вычета.
(стоимость квартиры — 1млн.р.) х 13% = сумма к уплате.
Если стоимость продаваемой квартиры не будет превышать 1 млн.р, то налог оплачивать не нужно.