Выполняю обязанности сотрудника, который на больничном уже 2 года, как отказаться от совмещения?

добый день

нужна консультация по трудовому кодексу

Добрый день! Два года назад устроился на работу инженером-теплотехником. Сразу же главный инженер ушел на больничный и так как в моей должностной инструкции написано, что в случае болезни главного инженера я исполняю его обязанности. Составили приказ на и.о. главного инженера я его подписал. Когда через 4 месяца больничный закончился, он ушел в отпуск. Затем в отпуске снова сел на больничный. Когда 4 месяца больничного закончились стал догуливать свой отпуск, но не догулял и снова сел на больничный. В 2015 году ни дня не отработав, но находясь на больничном взял отпуск за 2015 год и не отдохнув снова ушел на больничный. Сейчас прошло 2 года, человек получил инвалидность 3 группу (группа рабочая), ну и снова ушел на больничный.

У человека много хронических болезней, возможно, что и больничные по разным болезням. Я уже физически не могу выполнять обязанности за двоих, не говоря уже о том, что не могу заболеть или сходить в отпуск, но в моих должностных инструкциях черным по белому написано, что выполняю его обязанности. Кака мне кажется, в связи с тем, что организация бюджетная на лицо сговор гл.инженера, директора и врача. Такая ситуация мне кажется бесконечной, отдел кадров говорит все законно, а я вот не уверен. Хотя в трудовом кодексе нет ограничений по времени за совмещение. Хочется отказаться от совмещения, но как правильно сформулировать или понять законность нахождения на больничном не знаю…