Каким образом оформить отгрузку ИП продукции?

да. и если они не платят НДС, то тогда мы наверное должны все равно заплатить НДС или они предоставляют некий документ, что не плательщики НДС и тогда мы его тоже не платим?

я с такой ситуацией лично не сталкивался, но из текста Протокола следует, что ваш ИП может предоставить вместо Заявлеия документ об освобождении от уплаты НДС — в таком случае вы сможете подтвердить ставку 0% по экспорту.

Порядок уплаты НДС при экспорте товаров из России в страны ЕАЭС установлен Договором о Евразийском экономическом союзе (подписан в г. Астане 29.05.2014), в том числе Протоколом о порядке взимания косвенных налогов и механизме контроля за их уплатой при экспорте и импорте товаров, выполнении работ, оказании услуг (Приложение N 18 к Договору о Евразийском экономическом союзе) (далее — Протокол).

Для подтверждения права на применение нулевой ставки при экспорте в ЕАЭС налогоплательщик-экспортер представляет документы, указанные в п. 4 Протокола, в том числе он вправе представить любой из документов (пп. 3 п. 4 Протокола):
— заявление о ввозе товаров и уплате косвенных налогов, составленное по определенной форме, с отметкой налогового органа государства-члена, на территорию которого импортированы товары, об уплате косвенных налогов (освобождении или ином порядке исполнения налоговых обязательств) (на бумажном носителе в оригинале или в копии по усмотрению налоговых органов государств-членов);
— перечень заявлений (на бумажном носителе или в электронном виде с электронной (электронно-цифровой) подписью налогоплательщика).