Могут ли на меня подать в суд или прокуратуру?

Формально, в Ваших действиях содержаться признаки состава преступления, предусмотренного ст. 159, 285-286 УК РФ, можно и другие приписать, но в связи с тем, что действия носили не умышленный характер, присвоения или растраты денежных средств не имело место, а ущерб по данной категории уголовных дел (для их возбуждения) должен быть значительный для потерпевшего (2200 руб. для банка не та сумма), то в случае обращения Вашей коллеги в прокуратуру, Вас вызовут, возьмут объяснения и либо направят материалы в полицию или Следственный комитет, которые откажут в возбуждении уголовного дела, либо внесут Вашему бывшему руководителю представление об устранении нарушей. Коллега скорее всего ругается, так как официально вернуть данные средства (по каким статьям расходов например) ей будет несколько сложно или просто не хочет делать дополнительную работы.

Так что заявить она конечно может, но ее тоже будут вызывать, опрашивать, назначать служебную проверку и бухгалтерское исследование (в случае возбуждения дела экспертизу), опрешивать всех сотрудников компании и имеющих отношение к происшедшему работников банка… Вашему руководителю (бывшему) проще дать своему бухгалтеру распряжение о возврате денежных средств, поскольку вышеописанная процедура затруднит Вас меньше чем всех остольных. Так что не волнуйтесь, тюрьмой не пахнет )