Ст. 270 АПК РФ указывает основания для отмены или изменения решения суда первой инстанции. В частности, основанием для отмены решения арбитражного суда первой инстанции в любом случае является рассмотрение дела в отсутствие кого-либо из участвующих в деле лиц, НЕ ИЗВЕЩЕННЫХ НАДЛЕЖАЩИМ ОБРАЗОМ о времени и месте судебного заседания. Полагаю, что Ответчик был извещен о времени и месте судебного заседания по старому месту нахождения. При подаче иска к исковому прилагается выписка из ЕГРЮЛ, которая должна быть получена не более, чем за 30 дней до подачи ее с приложением к иску. Полагаю, что данный срок не нарушен, поэтому ответчик считается извещен надлежащим образом. Нужно знакомится с материалами дела для того, чтобы узнать о наличии почтового отправления иска с приложением и определением суда о назначении судебного заседания.С другой стороны, в почтовом извещении может стоять отметка о выбытии ЮЛ с указанного адреса. Тогда если есть такая отметка, то суд должен был запросить еще одну выписку из ЕГРЮЛ. Если есть такая отметка, то возможно суд апел. инстанции признает извещение ответчика ненадлежащим и отменит решение суда первой инстанции (ст. 270 АПК РФ). Если такой отметки о выбытии адресата нет, то нужно обжаловать решение суда первой инстанции, основываясь на нарушений норм материального и процессуального права (в зависимости от Ваших доводов). При этом ст. 268 АПК РФ гласит, что при рассмотрении дела в порядке апелляционного производства АС по имеющимся в деле и дополнительно представленным доказательствам повторно рассматривает дело. Дополнительные доказательства принимаются АС апелляц инст., если лицо, участвующее в деле, обосновало невозможность их представления в суд первой инстанции по причинам, не зависящим от него.
В вопросе не указано, что обе стороны ООО, поэтому возможен вариант рассмотрения в суде общей юрисдикции.