Здравствуйте Наталья!
Может, если Вы не ушли в отпууск по беременности и родам с даты, указанной в больничном листе и продолжали, а продолжали работать.
Согласно ст. 255 ТК РФ и ч. 1 ст. 10 Федерального закона от 29.12.2006 N 255-ФЗ «Об обеспечении пособиями по временной нетрудоспособности, по беременности и родам граждан, подлежащих обязательному социальному страхованию» пособие по беременности и родам выплачивается суммарно за весь период отпуска по беременности и родам. Если женщина имеет право на отпуск по беременности и родам, но не оформляет его, то основания для выплаты пособия по беременности и родам за этот период времени отсутствуют (письмо ФСС России от 08.10.2004 N 02-10/11-6671).
То есть, если 50 календарных дней Вы работали (имея на руках больничный, но не обращались к работодателю за отпуском по БиР), то оплате подлежат оставшиеся 90 дней.
При переводе из отдела в отдел от пуск сохранятся, так как Вы не увольняететсь из этой огранизации.