Добрый вечер! Вы на 6-процентной УСН, платить налог будете от оборота. Выставив счет с НДС вы будете обязаны заплатить сумму НДС, которую вы указали в счете, в бюджет из своего кармана. И налоговые вычеты по НДС вам недоступны. Контрагента понять можно, ему так выгоднее. Что делать вам?
1. Отказаться от отношений с данным контрагентом до конца налогового периода без НДС, а затем в следующем году вернуться на общий режим и к отношениям с данным партнером (не знаю, насколько для вам это приемлемо).
2. Переубедить контрагента поступиться своей выгодой.
3. Потерять право на применение УСН, не дожидаясь конца налогового периода, например, «показать» доходы более 68 млн. рублей или принять на работу более 100 работников (я не издеваюсь, а показываю все варианты).
4. Прекратить статус ИП немедленно и снова зарегистрироваться в качестве ИП, но на общей системе налогообложения. Получите другой ОГРНИП и начнете работать с НДС.
Последний вариант, мне кажется самый дешевый и удобный. Знал таких лиц, которые были вынуждены перерегистрироваться несколько раз из-за неверного выбора режима налогообложения.