Здравствуйте, Евгения!
В Вашем случае я бы порекомендовал заключать с работниками соглашения об изменении условий трудового договора (ст.72 Трудового кодекса РФ). Такое соглашение заключается в письменной форме, может заключаться сторонами в любой момент, дата вступления в силу такого соглашения также определяется сторонами. В процедуре заключения такого соглашения для работодателя не установлена обязанность направлять какие-либо уведомления, не установлены какие-либо сроки ожидания.
Кроме того, обращаю Ваше внимание, что изменение условий трудового договора в порядке ст. 74 Трудового кодекса РФ может быть произведено только в случае, когда по причинам, связанным с изменением организационных или технологических условий труда (изменения в технике и технологии производства, структурная реорганизация производства, другие причины), определенные сторонами условия трудового договора не могут быть сохранены. Выдача предписания ГИТ не является такой причиной по смыслу законодательной формулировки. А при отсутствии указанных причин изменение условий трудового договора в порядке ст. 74 ТК РФ будет являться нарушением трудового законодательства.
В любом случае, в государственных инспекциях труда существует практика продления сроков исполнения выданных предписаний (в том числе, и по отдельным пунктам). Для этого необходимо обратиться к инспектору с мотивированным заявлением о невозможности исполнения предписания в установленных срок, при этом к заявлению необходимо приложить документы, свидетельствующие о конкретных выполненных действиях (например, копии уже заключенных соглашений).