Здравствуйте, Елена.
Во-первых, Вам необходимо прочитать условия договора. Часто в договоре поставки указано, что «в случае если покупатель не подписал товарную накладную в течение… дней, то товар считается принятым без претензий».
Во-вторых, даже если такого условия нет, то фактически проблемы с налоговой в будущем могут возникнуть у самого покупателя. Ведь Вы продавец. Поэтому у Вас от операции возникает доход, а у покупателя — расход. Вы отразили доход и обложили его налогом.
Таким образом, у налоговой к Вам вопросов не будет. А вот у покупателя возникает расход (а если Вы работаете с НДС, то еще и вычет НДС). При ненадлежащем оформлении документов у покупателя возникают риски исключения расходов из налоговой базы, что приведет к доначислению налогов.
Спасибо за ответ, по поводу налогов понятно, мы переживаем что могут взыскать с нас денежные средства за поставленный нами товар, в договоре есть пункт "....в случае не согласия с качеством товара, ....написать претензию и акт в течении 2дней" этого сделано не было, поэтому это единст-я наша зацепка.