Добрый день, Валерий.
Если служебная квартира была предоставлена Вашему отцу для проживания вместе с семьей, в состав которой входила и была прописана с разрешения собственника и сводная сестра по линии матери, то выписка, или снятие с регистрации из жилого помещения осуществляется по инициативе самого жильца, или, при отсутствии его добровольного волеизъявления — на основании решения суда по иску собственника жилья (организации, предоставившей служебное жильё) при наличии достаточных на то оснований (например, непроживание в данном жилище на протяжении более полугода без каких либо уважительных причин).