Дарья, да, дети могут получить часть бабушкиной квартиры, которая причиталась их отцу. Каким путем, зависит от даты смерти в его свидетельстве
1. Если дата его смерти позже смерти матери, он успел стать ее наследником, но не принял наследство. Тогда право принять его долю переходит к его наследникам, то есть к детям (наследственная трансмиссия, ст. 1156 ГК РФ)
2. Если дата его смерти раньше смерти матери или в тот же день, дети наследуют бабушку напрямую вместо отца, по праву представления, и делят его долю поровну (ст. 1146, п. 2 ст. 1114 ГК РФ)
В обоих случаях от имени детей действует их законный представитель. Если срок уже прошел, его можно восстановить через суд, и довод сильный: отец числился пропавшим, о его гибели узнали только сейчас. Тогда суд определяет доли всех наследников, а выданное сестре свидетельство признает недействительным (п. 1 ст. 1155 ГК РФ). Есть и путь без суда: сестра письменно соглашается у нотариуса, что дети приняли наследство (п. 2 ст. 1155 ГК РФ)
Напишите в чат, какие даты смерти указаны в свидетельствах у матери и у сына и когда сестра получила свидетельство о наследстве, скажу, какой путь у детей и нужен ли суд