Здравствуйте!
Вы правы — ВПД на ветеранский отпуск положены независимо от основного, и отказ части противоречит действующему порядку.
Главный документ — Руководство по оформлению, использованию, хранению и обращению с ВПД в Вооружённых Силах РФ (приказ МО РФ от 06.06.2001 № 200).
Пункт 48 этого Руководства прямо перечисляет дополнительные отпуска, по которым выдаются ВПД «к месту проведения отпуска и обратно». В подпункте «д» названы именно «отпуска, установленные Федеральным законом «О статусе военнослужащих» —для военнослужащих — ветеранов боевых действий». Ваш 15-суточный отпуск (п. 5.1 ст. 11 Закона № 76-ФЗ) — это как раз он.
Пункт 45 (про «один раз в календарном году») касается основного отпуска и не «съедает» право на ВПД по дополнительному: это самостоятельные основания.
То есть логика штаба «сначала основной, потом ничего» здесь не работает: ветеранский отпуск — отдельное основание для выдачи ВПД. То, что основной отпуск вы провели по месту службы и документами не воспользовались, вообще не имеет значения — реализация права по одному основанию не прекращает право по другому.
Один нюанс, чтобы не было сюрпризов: 15 суток ветеранского отпуска предоставляются без увеличения на время проезда — в отличие, например, от отпуска по личным обстоятельствам. ВПД вам дадут, но время на дорогу к отпуску не добавят.
Если Вам понравился мой ответ, прошу отметить знаком "+".
Спасибо!
Буду благодарна за оценку ответа!