Здравствуйте.
Сестрам выплаты положены - они относятся к третьей очереди выгодоприобретателей и получат все причитающиеся суммы в равных долях, поскольку у брата нет ни жены, ни родителей, ни детей (это прямо следует из Указа Президента РФ и ФЗ о страховании военнослужащих).
Но есть важный нюанс, который в Вашей ситуации выходит на первый план. Брат до этого числился как без вести пропавший, и только теперь командир признал его погибшим в бою. Это не то же самое, что официальное свидетельство о смерти. Пока часть не оформит донесение о безвозвратных потерях и приказ об исключении из списков в связи со смертью, а военкомат не выдаст извещение (похоронку), ни одна выплата не пойдет - ни президентские 5 млн, ни страховая сумма, ни пособие по ФЗ №306. Это первое, что нужно проверить и, если нужно, ускорить.
Второй момент - место заключения контракта (Прокопьевск, Кемеровская обл.) влияет на то, куда именно подавать документы и какие региональные выплаты доступны сверх федеральных, а Москва здесь роли не играет, так как выплаты привязаны к месту службы/учета военнослужащего, а не к месту проживания сестер.
Получите конкретный план действий по ситуации: что сделать дальше, какие документы подготовить и на какие сроки ориентироваться.