Вера, здравствуйте.
Отказ незаконен, если дочь фактически живёт в деревне или на маршруте автобуса. Право на бесплатный подвоз даёт факт обучения в этой школе, а не прописка — ч. 2 ст. 40 ФЗ-273 «Об образовании», перевозку между поселениями обязан организовать муниципалитет как учредитель школы.
Подайте директору заявление об организации подвоза и попросите ответить письменно с указанием причины. Устные «она не наша» ничего не значат, а письменный отказ со ссылкой на прописку — готовое основание для жалобы.
Дальше жалоба в управление образования района и в прокуратуру, обычно всё решается уже на этапе запроса от прокурора, до суда такие споры почти не доходят.
Если ребёнок реально живёт в городе и вы хотите, чтобы автобус ездил за ней туда, — этого школа делать не обязана, маршрут утверждён для подвоза из конкретных населённых пунктов.