Однозначно сказать "можно" при таком раскладе нельзя - тут всё решает не расстояние от забора, а точная площадь закрытого кладбища, которая определяет размер санитарно-защитной зоны (СЗЗ). Согласно ст. 16 ФЗ № 8-ФЗ закрытое кладбище своей СЗЗ не лишается автоматически - она продолжает действовать, пока объект официально не рекультивирован и не переведён в зелёную зону (а это возможно не ранее чем через 20 лет после закрытия).
Норматив СЗЗ для кладбищ по санитарным правилам ступенчатый и зависит именно от площади: для небольших кладбищ (до 10 га) это может быть 50-100 метров, для более крупных - 300 метров, а для крупных закрытых с большой площадью захоронений - 500 метров. То есть Ваши "чуть больше 50 метров" от дома до кладбища могут спокойно укладываться в разрешённую застройку, а могут и не укладываться вообще - если СЗЗ у этого кладбища установлена в 100 или 300 метров, стройка на всём участке будет незаконной, независимо от того, где именно Вы поставите дом.
Второй момент - считать нужно не от забора СНТ, а от фактической границы кладбища (могильных оград) до стены будущего жилого дома. Если между забором и границей кладбища есть ещё какая-то полоса земли - расчёт может измениться не в Вашу пользу.
Если строительство начнётся, а потом окажется, что дом попадает в СЗЗ - по п. 2 Постановления Пленума ВС РФ № 44 это прямой признак самовольной постройки со всеми вытекающими: от отказа в регистрации до иска о сносе.
Получите конкретный план действий по ситуации: что сделать дальше, какие документы подготовить и на какие сроки ориентироваться.